Сотрудниками Центра мозга в сотрудничестве с Федеральным государственным бюджетным учреждением науки «Институт физиологии им. И.П. Павлова Российской академии наук» получен патент РФ «БАЗА ДАННЫХ ИЗОБРАЖЕНИЙ КЛЕТОК ГЛИОМЫ С6 ДЛЯ СЕГМЕНТАЦИИ И МОРФОЛОГИЧЕСКОГО АНАЛИЗА»
Разработчики: Малашин Р.О., Пашкевич С.Г., Илюхин Д.А., Ячная В.О., Волков А.В., Михалькова М.А.
База данных представляет собой коллекцию из 75 высококачественных изображений фазово-контрастной микроскопии формата TIFF, содержащих 19 000+ размеченных объектов (12 000+ клеток глиомы С6 двух морфологических типов и 7 000+ соматических ядер). Аннотации выполнены в формате JSON согласно структуре COCO COCO 1.0. База данных служит как эталоном, так и учебным ресурсом для моделей глубокого обучения в биомедицинском анализе изображений. База данных предназначена для повышения точности сегментации клеток и анализа их морфологии в исследовании опухолевых клеток и развитии методов для диагностики и терапии глиомы.
Область применения — медицина, биоинформатика, исследования раковых клеток, разработка и обучение ИИ-моделей для анализа микроскопических изображений. База данных включает два отдельных раздела — специализированный набор с четко контролируемыми параметрами для точной и надежной оценки моделей, а также базовая часть с разнообразными условиями съемки для проверки способности моделей к обобщению. Клетки аннотированы с разделением на два типа клеток по морфологическим признакам и дополнены разметкой сомы как компактного ядра клетки. Специализированный набор данных разбит на три части: обучающую, валидационную и тестовую, для применения при обучении моделей.